Расположено в Восточном административном округе на площади в 2 га. Кладбище основано в 1550 году. Находилось оно около села Гольяново на холмах в верхнем течении реки Сосенки. Название села происходит от слова «гольян» - так называлась небольшая рыбка-вьюнок, также в Сосенке водились пескари и гольцы. Кладбище примыкает к МКАД и расположено по соседству с заповедной зоной «Лосиный остров». По документам Патриаршего приказа за 1662 г. в Гольянове находилась деревянная церковь Зосимы и Совватия Соловецких. Такое посвящение храма необычно и к востоку от старой Москвы не встречается. В приход церкви входили не только жители Гольянова, но и окрестных деревень – Абрамцевой, Кобылиной, Орефцовой и Черницыной. Здание церкви стояло на берегу реки Сосенки. В 1776 г. туда перевезена утварь упраздненной Спасской церкви Красносельского дворца.
В 1811 г. владельцем села стал князь Иван Николаевич Трубецкой. При нем в южной части села, вместо старой деревянной церкви, строят каменный храм, освященный в 1842 г. Святилище построено в стиле позднего классицизма. Церковь состоит из небольшого храма типа ротонда на четверике с полукруглой апсидой, двух приделов: святых Адриана и Натальи (северный) и Богоматери «Живописный источник» (южный) и высокой трехъярусной колокольней. Северный и южный входы украшены колоннами дорического ордена. В духе ампира выполнен несложный рисунок венчающих карнизов, прямоугольные оконные проемы на четверике храма и апсиде, арочные на ротонде. Ограда кладбища построена во второй половине XIX в.
Церковь была закрыта после 1917 года и вновь освящена в 1990 году.
Гольяновское кладбище вошло в состав московских кладбищ в 1978 году. Архив по регистрации захороненных ведется с 1998 года. Гольяновское кладбище входит в состав Государственного унитарного предприятия "Ритуал".